Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMBRP28336 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMBRP28336 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms