Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ME2P23368 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ME2P23368 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ME2P23368 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ME2P23368 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ME2P23368 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ME2P23368 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ME2P23368 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ME2P23368 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ME2P23368 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ME2P23368 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ME2P23368 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ME2P23368 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ME2P23368 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ME2P23368 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ME2P23368 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ME2P23368 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ME2P23368 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ME2P23368 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ME2P23368 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ME2P23368 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ME2P23368 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ME2P23368 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ME2P23368 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ME2P23368 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ME2P23368 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms