Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPN3P20807 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms