Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMB1P20618 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms