Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD53P19397 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD53P19397 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms