Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ODC1P11926 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ODC1P11926 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODC1P11926 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODC1P11926 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODC1P11926 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODC1P11926 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODC1P11926 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODC1P11926 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODC1P11926 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODC1P11926 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ODC1P11926 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODC1P11926 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODC1P11926 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODC1P11926 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ODC1P11926 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODC1P11926 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODC1P11926 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODC1P11926 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ODC1P11926 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODC1P11926 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODC1P11926 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODC1P11926 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODC1P11926 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODC1P11926 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODC1P11926 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODC1P11926 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODC1P11926 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODC1P11926 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODC1P11926 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODC1P11926 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODC1P11926 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms