Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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