Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYBBP04839 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms