Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms