Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms