Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENRO43583 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms