Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

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Length 1,280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ZNF208O43345 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ZNF208O43345 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ZNF208O43345 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ZNF208O43345 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ZNF208O43345 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ZNF208O43345 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms