Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6BO15054 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms