Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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