Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE40O14503 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE40O14503 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE40O14503 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE40O14503 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE40O14503 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE40O14503 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE40O14503 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE40O14503 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE40O14503 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE40O14503 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE40O14503 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE40O14503 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE40O14503 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE40O14503 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE40O14503 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE40O14503 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE40O14503 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE40O14503 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE40O14503 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE40O14503 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE40O14503 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE40O14503 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE40O14503 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE40O14503 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE40O14503 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE40O14503 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE40O14503 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE40O14503 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE40O14503 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BHLHE40O14503 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BHLHE40O14503 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
BHLHE40O14503 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
BHLHE40O14503 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BHLHE40O14503 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BHLHE40O14503 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BHLHE40O14503 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BHLHE40O14503 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BHLHE40O14503 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BHLHE40O14503 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BHLHE40O14503 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BHLHE40O14503 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BHLHE40O14503 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BHLHE40O14503 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE40O14503 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE40O14503 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE40O14503 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE40O14503 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE40O14503 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE40O14503 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE40O14503 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms