Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms