Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms