Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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NPIPB13A6NJU9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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