Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms