Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR11A4FU01 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms