Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms