Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms