Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNOT11Q9UKZ1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNOT11Q9UKZ1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNOT11Q9UKZ1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNOT11Q9UKZ1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNOT11Q9UKZ1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CNOT11Q9UKZ1 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNOT11Q9UKZ1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNOT11Q9UKZ1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CNOT11Q9UKZ1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNOT11Q9UKZ1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms