Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms