Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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