Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD5Q9P267 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms