Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms