Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms