Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPRSS4Q9NRS4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms