Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms