Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms