Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI7

KRCC1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1Q9NPI7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRCC1Q9NPI7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms