Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IL1RAPQ9NPH3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms