Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms