Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2V7

SPNS1, Protein spinster homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1Q9H2V7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPNS1Q9H2V7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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