Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN6

SLC6A16, Orphan sodium- and chloride-dependent neurotransmitter transporter NTT5, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A16Q9GZN6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A16Q9GZN6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms