Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms