Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAGR1Q9BTK6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms