Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms