Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms