Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPOCK3Q9BQ16 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms