Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms