Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms