Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms