Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXNL1Q96CM4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms