Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms