Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms