Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LCN9Q8WX39 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms