Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms