Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC7Q8WUI4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms